7月16日,美国农业部的oriana beemer等发表了一篇关于口腔液检测的文章,题为assessing the value of pcr assays in oral fluidsamples for detecting african swine fever,classical swine fever, and foot-and-mouthdisease in u.s. swine(评价pcr检测口腔液样本对(美国养猪业里)检测非洲猪瘟、典型猪瘟和猪口蹄疫的价值),文章信息如下:
内容速览
介绍:
口腔液取样和检测为评价猪的健康状况提供了一种方便、无干扰的机制,特别是生长育肥猪。
本评估使用实时逆转录酶聚合酶链反应(rrt-pcr)检测口腔液样本来评估潜在检测价值,用以检测非洲猪瘟、经典猪瘟或口蹄疫,以便在疾病暴发期间进行监测和在无疾病环境中的早期发现。
方法:
我们使用了一系列逻辑论证、有根据的假设以及来自文献和行业实践的一系列参数值来评估口腔液采样和rrt-pcr检测为上述猪的目标外来动物疾病监测提供的信息的成本和价值。
假设+文献和实践数据,本文并未做实验
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结果:
根据评估,口腔液测试证明了评估的两种设置的价值。
最大的价值是在疫病暴发情况下,使用口腔液将最大限度地减少对动物和养殖活动的干扰,减少23%-40%的样品量,并相对于当前单个动物抽样计划来说减少了资源需求。
早期检测系统方面,每3天进行采样符合设计的患病率检测阈值(概率为0.95),但成本非常高。
局限性
由于一些限制和信息空白,目前还不可能对非洲猪瘟、经典猪瘟或口蹄疫监测实施口腔液检测。
这些空白包括:
对非洲猪瘟、典型猪瘟或猪口蹄疫的口腔液样本的pcr诊断方案和试剂盒的验证;
在现场设置中测试性能的最小信息;
这些外来动物疾病病毒的低毒力毒株检测窗口;
以及验证性测试协议开发的需要。
评估是评估,现实归现实,最好补齐这些空白
评估是评估,现实归现实,最好补齐这些空白
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以下是正文
介绍:
口腔液样本是由唾液和粘膜粘膜渗出物组成的聚合样本,其中可能含有在畜群中循环的病原体,病原体抗体,或两者兼而有之。
收集口腔液样本为评价猪的健康状况提供了一种方便、无干扰的机制,特别是对于那些接近屠宰和即将被屠宰的猪群——即生长育肥猪。
口腔液收集利用了猪的自然行为。收集样本的方法是把棉绳挂在猪舍中的一个或多个围栏里,让猪咀嚼20-30分钟,这样对动物的活动或猪场运营造成的干扰最小。
样本采集的便利性和仅用一个样本就能从整个群体获得疾病状况信息的能力,再加上其对地方性疾病的广泛行业应用,使得口腔液检测成为一种用于猪病原体的现场监测的强有力的方法。只需要很少的培训,养猪人就可以收集和提交用以监测谷仓或房地的疾病状况样本,不需要增加额外的成本、限制和由兽医或动物卫生技术人员访问养殖场引起的生物安全问题。
目前,有三个高通量实验室每年对大概30000个样本进行诊断检测,这些实验室的检测覆盖了包括猪肠道冠状病毒病(secd)、猪繁殖和呼吸综合征(prrs)、猪甲型流感病毒(iav-s)等250多种美国国内的病原体。
已经应用于口腔检测的检测方法有实时反转录聚合酶链式反应(rrt-pcr)、固相竞争酶联免疫吸附实验(elisa)、病毒分离、测序和双抗体夹心elisa。许多研究都集中在rrt-pcr的应用上,包括单重pcr和多重pcr;本文采用单重pcr法进行评估。针对其他疾病的样本类型的诊断检测也已经被开发,包括本评估中考虑的外来动物疾病:非洲猪瘟(asf)、经典猪瘟(csf)和口蹄疫(fmd)。
应用于口腔液样本的rrt-pcr检测方法的敏感性取决于发现靶病毒的基质、影响目标病毒浓度或组成的宿主因素以及样品质量等非宿主因素,其中非宿主因素又包括由于处理不当或过度污染环境而导致的样品变质。
具有目的病毒的基质可能含有抑制剂从而阻碍检测方法有效工作。
口腔样品中目标病毒的丰度或浓度是一个宿主因素,这一因素取决于个体动物口腔渗出液中的组织液浓度、收集时咀嚼绳索的动物数量以及唾液中的病毒释放情况,以及绳子取样相对于病毒释放窗口的时效性。
在田间实验中,患病动物可能只代表动物种群特定围栏中的一部分。来自一项实验感染asf,csf或fmd的猪的研究的现有信息表明,被感染的动物出现严重的临床症状后才在绳索上咀嚼,同时或在此之后,在口腔液样品中检测到了病毒。
关于绳样取样相对于病毒释放的实效性,重要的是要注意,本评估中考虑的所有三种疾病的潜伏期和感染期均因病毒毒株及其毒力而异。
根据实验室研究,asf和fmd在临床症状出现前就可在口腔液样本中检测到,而且通常伴随着发热。
而csfv在临床症状出现的同时或之后才能在口腔液中检测到。持续性感染csf的猪大部分可能是由于子宫内垂直传播或出生后不久感染所致。在这种情况下,可能没有明显的临床症状,检测不到抗体,但猪将继续释放病毒。
一些asf和csf的毒株可能出现与地方病难以区分的轻微临床症状,仅凭临床症状难以诊断。
由于rrt-pcr诊断的使用尚未在美国被正式验证用于检测asf,csf或fmd的口腔液样品,因此本文使用了一系列逻辑论证,有效的假设和一系列参数精度测试等, 探索了筛选后的四种口腔液采样和rrt-pcr检测的假设应用。
这些假设应用用于说明这种采样方式如何应用于疫情监测和作为筛查测试在无疾病环境的早期检测。
所有的应用都需要充分考虑在监管框架内实施之前进行额外的优化。 一系列其他情景和与当前监测系统的直接比较都超出了本研究的范围,应通过其他项目来进行探讨。
未完待续,敬请关注
本文由《中国动物保健》杂志社新媒体总监周盼伊和康涅狄格州立大学蔺涛博士翻译整理
文章仅代表原作者观点
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